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Genomics Secondary Analysis Accelerated Solution - 
WASAI Lightning™ Family

​產品介紹

WASAI-Lightning™ 系列提供基因定序分析加速一體機解決方案。結合基因組分析工具 (GATK)、Intel CPU 及其高性能FPGA加速卡,讓30x全基因組定序資料分析效能可提升11倍。 WASAI Lighting Family 採用高度一致的標準分析流程、簡化設計以降低總營運成本,改善用戶使用體驗。

WASAI Lightning™—加速基因組學分析流程

全基因組數據資料 NA12878 30X

●   BWA-MEM (0.7.17-r1188)
●   Sort & Markdup
●   GATK (4.0.x~4.1.x) HaplotypeCaller

Performance Comparison with Generic HPC.jpg

下圖顯示了WASAI Lightning 於一節點單日可分析數據量、全基因組定序分析時間、分析效能,
三個方面皆優於高效能運算伺服器。
 

WASAI Lightning™ – 三種通量模式帶來最佳ROI

WASAI-Lightning™ 系列以三種強大的形式出現,滿足任何客戶需求。藉由三種不同通量模式,客戶可購買最適合其實驗室或研究中心需求的模式。 

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Lightning:基礎款更靈活,可搭配1U/2U/Tower式伺服器。每個節點單日運算通量為 4.8 WGS。適合小型實驗室,每年 WGS 樣本不超過 1,800 個 WGS 樣本。 


Lightning S:標準款支持 2U 服務器,具工作指派 (job scheduler)功能,可支持高效能運算叢集(cluster)。每節點單日運算通量為 8 WGS。可提供近 3000 個 WGS 樣本的年吞吐量,但價格更具競爭力。


Lightning Plus:高端機型,單節點單日運算通ㄌ樣最高可達 12 WGS。通過多張FPGA卡平行運算,每個基因組數據執行時間最快。每年吞吐量高達 4380個WGS樣本。此版本附帶了工作指派(job scheduler) 功能,也支持高效能運算叢集(cluster)。

基於英特爾® FPGA 可編程加速的 Lightning™

WASAI Lightning Genomics solution runs on Intel PAC.png

Intel認證伺服器資訊 

   英特爾 PAC Arria® 10 GX
   英特爾 PAC D5005 

WASAI Lightning解決方案搭配Intel認證FPGA伺服器解決基因定序數據分析瓶頸。

視覺化基因組學分析平台 -簡單易用! 

WASAI-Lightning™ Manager是一個視覺化線上操作介面精簡容易操作。能自動分析基因組資料,縮短整體分析時間。可透過WASAI-Lightning™ Manager管理和監控資料分析狀態!

  • 隨插隨用: 不須其他系統安裝,即時上傳樣本和執行WASAI-Lightning™ 

  • 省時自動化:自動化基因組分析管理提升分析效率

  • 易於管理:  視覺化分析監控和版本管理

  • 易於同步/共享: 方便與研究團隊分享分析結果

  • 良好的使用者介面  提供視覺化使用者介面掌控FASTQ 數據轉換為 VCF 時間

基因定序分析加速一體機解決方案

   集成英特爾FPGA加速卡及認證伺服
   加速 GATK Best Practice pipeline
   WGS NA12878 30x 於 3 小時內完成
   準確性與 GATK Best Practice 一致
   應用於 WGS 和 WES(包含 Germline / Somatic)

特徵

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​高效能

全基因組定序樣本於3小時內完成

accuracy & consistency

高精度和一致性

基於原生演算法BWA-MEA 和 GATK

​與公認分析流程一致性高

cost-efficient

成本效益

具優惠價格,最大限度

降低硬體採購成本

flexibility

靈活性

可安裝多種開源基因組分析工具,

具便利性與靈活性

All-in-one pipeline

All-in-one一體機

整合FPGA加速卡與伺服器

​易於部屬提供最佳效能

reconfigurable

​可重構性

FPGA卡可遠端即時更新 

讓系統保持最新狀態

應用領域

嚴重急性傳染病疫苗和治療開發(如 COVID-19)

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產前和產後基因檢測

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人口世代研究

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環境基因體學

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癌症和罕病研究藥物開發

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預防基因組學與精準醫療篩查

Agrigenomic.png

農業基因組學

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